関西地域における納豆の消費向上と拡大を目指す関西の納豆生産事業者有志により昭和29年に組織されました。昭和56年（1981）には関西地域限定の記念日として7月10日を「納豆の日」に制定。この日はその後、平成4年（1997）に全国納豆共闘組合連合会が改めて制定したことで全国的な記念日となっています。
当組合は納豆の付加価値を高めることを目的に歩みを続けてまいりました。関西地域は納豆を食べる習慣があまりないと言われていますが、本来納豆は京都にルーツをもち関西にゆかりの深い食品です。近年では納豆は日本の伝統食であると同時に健康維持にも良い食品として改めて注目され、関西でも納豆食の習慣が定着しつつあります。これからも当組合では、納豆を通じた健康長寿社会実現への貢献を願い、努めてまいります。